我院成立于1953年，是國家創建的首批工程勘察設計機構之一。經歷了學習起步、獨立自主、曲折前進的創立與成長的艱辛歷程，從幾十人的設計隊伍發展到近千人，逐步成長為集設計、科研為一體，具有專業特色的國家級大型設計院。20多年來，完成了我國電子工業絕大部分工廠、學校和研究所的工程設計工作；積極開展電子工程建設的研究與開發，在潔凈廠房、純水處理、電磁屏蔽、防微振、非標準設備等方面取得一大批科研成果；承擔了對朝鮮、越南、羅馬尼亞等國家的近20個援外項目。隨著國家部委的分合，我院的名稱亦多次改變。1976年開始，對外稱中國電子工程設計院。

在改革開放的大好形勢下，我院步入發展壯大的新階段，由單純的事業單位逐步轉變為能夠承擔大型工程建設項目，具有較強綜合實力和競爭能力的科技型企業。1980年開始，承擔了國內幾乎全部彩管、玻殼的設計工作，為我國在短短十幾年時間成為世界彩電大國做出了積極貢獻。1984年，實行事業單位企業化管理，管理體制和運行機制進行了重大改革。在工程設計快速發展的同時，堅持一業為主，多種經營：縱向，以設計為主，向兩頭延伸；橫向，從電子工業向航空航天、郵電通訊、生物醫藥、智能建筑、民用建筑等領域跨行業發展。1979年成立了深圳分院，隨后在海南、上海、蘇州、廈門、大連等地設立了直屬和分支機構，項目遍布全國。

新世紀以來，我院積極適應市場變化，不斷推進企業的改制與轉型，大力開展技術創新、業務創新、管理創新、商業模式創新，形成了以設計為龍頭的工程建設全過程、多方位、寬領域的服務系統，逐步成為創新型工業工程、民用建筑和節能環保及相關建設領域具有專業化、國際化的集成服務提供商和組織者。2000年，成為中央直接管理的十家大型勘察設計單位之一。2003年，由國務院國資委管理，同年完成業務重組、主業改制、輔業分離工作。2009年，整體并入國家開發投資集團有限公司。在持續擴展并保持工業工程、民用建筑領域優勢地位的同時，積極開拓節能環保新能源業務并成為行業領先者，構建了集聚人才、自主技術研發和工程化應用的開放式創新平臺。積極開拓海外市場，業務覆蓋亞洲、非洲和美洲。我院將進一步完善科技創新與技術服務平臺、構建工程管理平臺，實現跨越式發展。